В целом по России сохранятся лишь маршруты из Москвы в Краснодар, Челябинск, Владикавказ и Ростов-на-Дону. Из Краснодара — в Сочи, Тель-Авив, Дубай, Ереван, Стамбул. Новая объединенная компания будет делать ставку на чартерные программы.
Стоит отметить, что после объединения, «Авиалиний Кубани» откажутся от 11 самолетов Як-42 и будут работать на технике своего партнера – Аэробусах и Боингах.